Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms