Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP8Q99708 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms