Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCNAQ96QF7 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCNAQ96QF7 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms