Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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SGF29Q96ES7 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
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SGF29Q96ES7 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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SGF29Q96ES7 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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SGF29Q96ES7 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
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SGF29Q96ES7 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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SGF29Q96ES7 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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SGF29Q96ES7 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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SGF29Q96ES7 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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