Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CLDN23Q96B33 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CLDN23Q96B33 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CLDN23Q96B33 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CLDN23Q96B33 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CLDN23Q96B33 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CLDN23Q96B33 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CLDN23Q96B33 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CLDN23Q96B33 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CLDN23Q96B33 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CLDN23Q96B33 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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