Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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ZNF248Q8NDW4 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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ZNF248Q8NDW4 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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ZNF248Q8NDW4 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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ZNF248Q8NDW4 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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ZNF248Q8NDW4 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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ZNF248Q8NDW4 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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ZNF248Q8NDW4 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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ZNF248Q8NDW4 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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ZNF248Q8NDW4 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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