Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT1

SCN4B, Sodium channel subunit beta-4, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4BQ8IWT1 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCN4BQ8IWT1 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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