Protein–RNA interactions for Protein: Q86V20

FAM35A, Protein FAM35A, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM35AQ86V20 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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FAM35AQ86V20 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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FAM35AQ86V20 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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FAM35AQ86V20 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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FAM35AQ86V20 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM35AQ86V20 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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