Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMZ3

SYNE3, Nesprin-3, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE3Q6ZMZ3 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNE3Q6ZMZ3 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms