Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD4L3Q6VB84 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms