Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMIGD1Q6UXZ0 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms