Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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