Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms