Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SSX1Q16384 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
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SSX1Q16384 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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SSX1Q16384 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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SSX1Q16384 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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SSX1Q16384 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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SSX1Q16384 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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SSX1Q16384 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SSX1Q16384 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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