Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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VPS72Q15906 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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VPS72Q15906 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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VPS72Q15906 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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VPS72Q15906 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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VPS72Q15906 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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VPS72Q15906 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VPS72Q15906 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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