Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 KCNJ5-202ENST00000529694 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 SH3BP2-203ENST00000442312 9211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
USF2Q15853 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
USF2Q15853 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
USF2Q15853 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
USF2Q15853 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
USF2Q15853 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
USF2Q15853 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
USF2Q15853 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
USF2Q15853 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
USF2Q15853 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
USF2Q15853 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
USF2Q15853 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
USF2Q15853 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
USF2Q15853 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
USF2Q15853 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
USF2Q15853 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
USF2Q15853 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
USF2Q15853 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
USF2Q15853 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
USF2Q15853 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
USF2Q15853 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
USF2Q15853 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
USF2Q15853 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
USF2Q15853 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
USF2Q15853 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
USF2Q15853 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
USF2Q15853 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
USF2Q15853 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
USF2Q15853 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
USF2Q15853 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
USF2Q15853 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
USF2Q15853 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
USF2Q15853 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
USF2Q15853 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
USF2Q15853 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
USF2Q15853 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
USF2Q15853 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
USF2Q15853 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
USF2Q15853 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
USF2Q15853 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
USF2Q15853 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
USF2Q15853 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
USF2Q15853 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
USF2Q15853 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
USF2Q15853 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
USF2Q15853 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
USF2Q15853 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
USF2Q15853 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
USF2Q15853 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
USF2Q15853 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
USF2Q15853 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
USF2Q15853 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
USF2Q15853 DGCR5-203ENST00000438934 5492 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
USF2Q15853 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
USF2Q15853 CACNA1G-218ENST00000507510 7014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
USF2Q15853 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 AC099489.1-203ENST00000598234 10568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 CREBL2-201ENST00000228865 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 CACNA1G-211ENST00000503485 6768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 STARD8-203ENST00000374599 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 GFRA1-203ENST00000369236 9109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
USF2Q15853 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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