Protein–RNA interactions for Protein: Q15835

GRK1, Rhodopsin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRK1Q15835 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GRK1Q15835 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GRK1Q15835 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms