Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC85BQ15834 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC85BQ15834 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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