Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRIP4Q15650 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRIP4Q15650 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
TRIP4Q15650 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRIP4Q15650 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRIP4Q15650 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRIP4Q15650 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIP4Q15650 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIP4Q15650 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIP4Q15650 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIP4Q15650 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIP4Q15650 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIP4Q15650 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIP4Q15650 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIP4Q15650 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIP4Q15650 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIP4Q15650 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIP4Q15650 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIP4Q15650 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIP4Q15650 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIP4Q15650 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIP4Q15650 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIP4Q15650 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIP4Q15650 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIP4Q15650 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIP4Q15650 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms