Protein–RNA interactions for Protein: Q15404

RSU1, Ras suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSU1Q15404 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSU1Q15404 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
RSU1Q15404 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
RSU1Q15404 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
RSU1Q15404 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
RSU1Q15404 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
RSU1Q15404 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RSU1Q15404 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RSU1Q15404 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RSU1Q15404 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RSU1Q15404 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RSU1Q15404 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RSU1Q15404 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RSU1Q15404 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RSU1Q15404 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RSU1Q15404 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RSU1Q15404 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RSU1Q15404 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RSU1Q15404 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RSU1Q15404 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RSU1Q15404 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RSU1Q15404 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RSU1Q15404 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RSU1Q15404 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RSU1Q15404 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RSU1Q15404 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RSU1Q15404 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RSU1Q15404 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RSU1Q15404 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RSU1Q15404 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RSU1Q15404 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RSU1Q15404 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RSU1Q15404 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RSU1Q15404 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RSU1Q15404 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RSU1Q15404 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms