Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 FN1-209ENST00000432072 7759 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.862e-9■■□□□ 14
PCBP2Q15366 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.457e-12■■□□□ 14
PCBP2Q15366 HELZ-206ENST00000579953 6365 ntTSL 25.79□□□□□ -1.487e-12■■□□□ 14
PCBP2Q15366 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.897e-12■■□□□ 14
PCBP2Q15366 USP11-204ENST00000377107 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.394e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 USP11-206ENST00000469080 3467 ntTSL 1 (best)11.86□□□□□ -0.514e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 USP11-201ENST00000218348 3338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.864e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.235e-8■■□□□ 14
PCBP2Q15366 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.472e-6■■□□□ 14
PCBP2Q15366 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.547e-9■■□□□ 14
PCBP2Q15366 PHF21A-213ENST00000530312 276 ntTSL 324.49■■□□□ 1.512e-6■■□□□ 14
PCBP2Q15366 PHF21A-211ENST00000529734 557 ntTSL 413.12□□□□□ -0.312e-6■■□□□ 14
PCBP2Q15366 PHF21A-218ENST00000532883 1051 ntTSL 57.35□□□□□ -1.232e-6■■□□□ 14
PCBP2Q15366 PHF21A-203ENST00000524497 555 ntTSL 54.16□□□□□ -1.742e-6■■□□□ 14
PCBP2Q15366 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.365e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.345e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.25e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 MROH6-208ENST00000533210 2312 ntTSL 1 (best)21.17■□□□□ 0.985e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.815e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.785e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 CC2D1A-204ENST00000587508 1667 ntTSL 519.79■□□□□ 0.765e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.715e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.625e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 MROH6-206ENST00000533083 667 ntTSL 318.49■□□□□ 0.555e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 MROH6-205ENST00000532862 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 318.39■□□□□ 0.535e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.465e-16■■□□□ 14
PCBP2Q15366 MROH6-209ENST00000533582 305 ntTSL 317.89■□□□□ 0.455e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 CHPF2-203ENST00000482173 548 ntTSL 417.78■□□□□ 0.445e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.415e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 ARHGAP33-208ENST00000588248 2004 ntTSL 517.5■□□□□ 0.395e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 SYNJ2-206ENST00000485863 810 ntTSL 316.98■□□□□ 0.315e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.265e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 COL6A1-204ENST00000486023 968 ntTSL 216.5■□□□□ 0.235e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.235e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 COL6A1-206ENST00000498614 2358 ntTSL 1 (best)15.98■□□□□ 0.155e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 CC2D1A-203ENST00000586955 2743 ntTSL 1 (best)15.8■□□□□ 0.125e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -05e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 PI4KB-205ENST00000430800 965 ntTSL 514.92□□□□□ -0.025e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 RBM10-204ENST00000478410 847 ntTSL 514.86□□□□□ -0.035e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.045e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.095e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 ARHGAP33-206ENST00000587447 2983 ntTSL 1 (best)14.42□□□□□ -0.15e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 PI4KB-211ENST00000489223 558 ntTSL 414.13□□□□□ -0.155e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 PI4KB-206ENST00000438243 1150 ntTSL 213.78□□□□□ -0.25e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.225e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.234e-13■■□□□ 14
PCBP2Q15366 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.255e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.265e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 TMEM9B-AS1-203ENST00000534349 383 ntTSL 513.28□□□□□ -0.285e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.295e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 PI4KB-201ENST00000368872 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.345e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.355e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.355e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 ARHGAP33-203ENST00000314737 3858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.365e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.375e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 TBC1D5-216ENST00000444471 680 ntTSL 312.42□□□□□ -0.425e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 TBC1D5-226ENST00000481396 609 ntTSL 412.42□□□□□ -0.425e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 PI4KB-202ENST00000368873 3340 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.465e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 MIF4GD-214ENST00000618645 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.485e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 CHPF2-201ENST00000035307 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.525e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 PI4KB-204ENST00000368875 3983 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.535e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 ZNF585A-206ENST00000588723 670 ntTSL 311.57□□□□□ -0.565e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 LINC00963-201ENST00000412141 739 ntTSL 1 (best)10.77□□□□□ -0.695e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 AC012309.1-201ENST00000588873 389 ntAPPRIS P1 TSL 510.51□□□□□ -0.735e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 DCP1A-205ENST00000560624 849 ntTSL 310.44□□□□□ -0.745e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 TMEM9B-AS1-202ENST00000532599 615 ntTSL 310.4□□□□□ -0.745e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 SMG1-205ENST00000561947 2664 ntTSL 59.69□□□□□ -0.865e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 INPP5A-201ENST00000342652 832 ntTSL 59.57□□□□□ -0.885e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 ZNF585A-204ENST00000587817 2316 ntTSL 29.03□□□□□ -0.965e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 LINC00963-204ENST00000427778 382 ntTSL 28.32□□□□□ -1.085e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 ZNF585A-202ENST00000356958 6822 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.085e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 SMG1-210ENST00000565224 2372 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.265e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 DCP1A-201ENST00000294241 1853 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.265e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 SMG1-215ENST00000568239 2978 ntTSL 1 (best)6.92□□□□□ -1.35e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.335e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.375e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 TBC1D5-228ENST00000486224 526 ntTSL 35.42□□□□□ -1.545e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.64e-13■■□□□ 14
PCBP2Q15366 TBC1D5-212ENST00000433533 471 ntTSL 34.26□□□□□ -1.735e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 KMT2A-210ENST00000532204 499 ntTSL 218.33■□□□□ 0.523e-6■■□□□ 14
PCBP2Q15366 KMT2A-209ENST00000531904 4320 ntTSL 217.92■□□□□ 0.463e-6■■□□□ 14
PCBP2Q15366 KMT2A-206ENST00000527869 481 ntTSL 316.59■□□□□ 0.253e-6■■□□□ 14
PCBP2Q15366 KMT2A-211ENST00000533790 804 ntTSL 216.59■□□□□ 0.253e-6■■□□□ 14
PCBP2Q15366 KMT2A-208ENST00000529852 3323 ntTSL 212.29□□□□□ -0.443e-6■■□□□ 14
PCBP2Q15366 ETV4-206ENST00000585508 760 ntTSL 518.04■□□□□ 0.481e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 MLLT6-208ENST00000619356 3868 ntTSL 1 (best)14.53□□□□□ -0.082e-7■■□□□ 14
PCBP2Q15366 LIMS1-205ENST00000410093 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.264e-8■■□□□ 14
PCBP2Q15366 HSPG2-211ENST00000486901 3586 ntTSL 211.97□□□□□ -0.492e-37■■□□□ 14
PCBP2Q15366 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.131e-6■■□□□ 14
PCBP2Q15366 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.796e-8■■□□□ 13.9
PCBP2Q15366 LRCH4-204ENST00000476881 1675 ntTSL 219.51■□□□□ 0.716e-8■■□□□ 13.9
PCBP2Q15366 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.596e-8■■□□□ 13.9
PCBP2Q15366 LRCH4-205ENST00000485554 774 ntTSL 316.28■□□□□ 0.26e-8■■□□□ 13.9
PCBP2Q15366 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.176e-8■■□□□ 13.9
PCBP2Q15366 LRCH4-202ENST00000467201 4754 ntTSL 214.94□□□□□ -0.026e-8■■□□□ 13.9
PCBP2Q15366 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.755e-7■■□□□ 13.9
PCBP2Q15366 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.526e-7■■□□□ 13.9
PCBP2Q15366 IL1R1-203ENST00000409589 3544 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.836e-7■■□□□ 13.9
PCBP2Q15366 C6orf89-204ENST00000480824 6861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.055e-9■■□□□ 13.9
PCBP2Q15366 C6orf89-202ENST00000359359 2565 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.155e-9■■□□□ 13.9
Retrieved 100 of 29,421 protein–RNA pairs in 293.8 ms