Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PCOLCEQ15113 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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