Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHPRHQ149N8 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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