Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC10A1Q14973 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms