Protein–RNA interactions for Protein: Q14432

PDE3A, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase A, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3AQ14432 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDE3AQ14432 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.66
PDE3AQ14432 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE3AQ14432 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE3AQ14432 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE3AQ14432 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE3AQ14432 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDE3AQ14432 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms