Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

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Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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SPIDRQ14159 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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SPIDRQ14159 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPIDRQ14159 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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