Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CKAP5Q14008 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CKAP5Q14008 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CKAP5Q14008 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CKAP5Q14008 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CKAP5Q14008 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CKAP5Q14008 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CKAP5Q14008 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CKAP5Q14008 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CKAP5Q14008 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CKAP5Q14008 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CKAP5Q14008 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CKAP5Q14008 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CKAP5Q14008 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CKAP5Q14008 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CKAP5Q14008 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CKAP5Q14008 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CKAP5Q14008 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CKAP5Q14008 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CKAP5Q14008 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CKAP5Q14008 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CKAP5Q14008 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CKAP5Q14008 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CKAP5Q14008 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CKAP5Q14008 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CKAP5Q14008 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CKAP5Q14008 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CKAP5Q14008 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CKAP5Q14008 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CKAP5Q14008 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CKAP5Q14008 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CKAP5Q14008 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CKAP5Q14008 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CKAP5Q14008 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CKAP5Q14008 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CKAP5Q14008 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CKAP5Q14008 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CKAP5Q14008 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CKAP5Q14008 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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CKAP5Q14008 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
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CKAP5Q14008 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CKAP5Q14008 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CKAP5Q14008 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CKAP5Q14008 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
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CKAP5Q14008 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
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CKAP5Q14008 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CKAP5Q14008 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CKAP5Q14008 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CKAP5Q14008 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CKAP5Q14008 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CKAP5Q14008 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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