Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms