Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PMS2P11Q13670 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms