Protein–RNA interactions for Protein: Q13573

SNW1, SNW domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNW1Q13573 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNW1Q13573 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms