Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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PMS2P3Q13401 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
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PMS2P3Q13401 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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PMS2P3Q13401 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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PMS2P3Q13401 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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PMS2P3Q13401 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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