Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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FOXF2Q12947 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
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