Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
COX10Q12887 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
COX10Q12887 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
COX10Q12887 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
COX10Q12887 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
COX10Q12887 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
COX10Q12887 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
COX10Q12887 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
COX10Q12887 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
COX10Q12887 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
COX10Q12887 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
COX10Q12887 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
COX10Q12887 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
COX10Q12887 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
COX10Q12887 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
COX10Q12887 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
COX10Q12887 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
COX10Q12887 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
COX10Q12887 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
COX10Q12887 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
COX10Q12887 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
COX10Q12887 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
COX10Q12887 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
COX10Q12887 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
COX10Q12887 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
COX10Q12887 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
COX10Q12887 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
COX10Q12887 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
COX10Q12887 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
COX10Q12887 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
COX10Q12887 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
COX10Q12887 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
COX10Q12887 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
COX10Q12887 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
COX10Q12887 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
COX10Q12887 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
COX10Q12887 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
COX10Q12887 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
COX10Q12887 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
COX10Q12887 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
COX10Q12887 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
COX10Q12887 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
COX10Q12887 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
COX10Q12887 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
COX10Q12887 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
COX10Q12887 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
COX10Q12887 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
COX10Q12887 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
COX10Q12887 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
COX10Q12887 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
COX10Q12887 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
COX10Q12887 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
COX10Q12887 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
COX10Q12887 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
COX10Q12887 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
COX10Q12887 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
COX10Q12887 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
COX10Q12887 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
COX10Q12887 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
COX10Q12887 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
COX10Q12887 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
COX10Q12887 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
COX10Q12887 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
COX10Q12887 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
COX10Q12887 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
COX10Q12887 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
COX10Q12887 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
COX10Q12887 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
COX10Q12887 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
COX10Q12887 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
COX10Q12887 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
COX10Q12887 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
COX10Q12887 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
COX10Q12887 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
COX10Q12887 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
COX10Q12887 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
COX10Q12887 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
COX10Q12887 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
COX10Q12887 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
COX10Q12887 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
COX10Q12887 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
COX10Q12887 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
COX10Q12887 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
COX10Q12887 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
COX10Q12887 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
COX10Q12887 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
COX10Q12887 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
COX10Q12887 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
COX10Q12887 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
COX10Q12887 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
COX10Q12887 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
COX10Q12887 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
COX10Q12887 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
COX10Q12887 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
COX10Q12887 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
COX10Q12887 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
COX10Q12887 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
COX10Q12887 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
COX10Q12887 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
COX10Q12887 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
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