Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TROQ12816 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TROQ12816 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TROQ12816 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TROQ12816 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TROQ12816 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TROQ12816 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TROQ12816 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TROQ12816 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TROQ12816 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TROQ12816 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TROQ12816 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TROQ12816 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TROQ12816 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TROQ12816 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TROQ12816 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TROQ12816 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TROQ12816 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TROQ12816 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TROQ12816 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TROQ12816 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TROQ12816 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TROQ12816 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TROQ12816 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TROQ12816 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TROQ12816 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TROQ12816 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TROQ12816 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TROQ12816 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TROQ12816 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TROQ12816 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TROQ12816 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TROQ12816 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TROQ12816 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TROQ12816 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TROQ12816 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TROQ12816 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TROQ12816 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TROQ12816 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TROQ12816 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TROQ12816 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TROQ12816 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TROQ12816 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TROQ12816 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TROQ12816 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TROQ12816 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TROQ12816 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TROQ12816 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TROQ12816 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TROQ12816 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TROQ12816 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TROQ12816 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TROQ12816 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TROQ12816 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TROQ12816 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TROQ12816 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TROQ12816 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TROQ12816 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TROQ12816 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TROQ12816 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TROQ12816 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TROQ12816 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TROQ12816 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TROQ12816 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TROQ12816 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TROQ12816 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TROQ12816 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TROQ12816 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TROQ12816 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TROQ12816 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TROQ12816 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TROQ12816 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TROQ12816 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TROQ12816 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TROQ12816 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TROQ12816 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TROQ12816 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TROQ12816 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TROQ12816 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TROQ12816 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TROQ12816 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TROQ12816 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TROQ12816 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TROQ12816 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TROQ12816 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TROQ12816 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TROQ12816 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TROQ12816 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TROQ12816 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TROQ12816 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TROQ12816 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TROQ12816 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TROQ12816 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TROQ12816 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TROQ12816 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TROQ12816 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TROQ12816 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TROQ12816 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TROQ12816 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TROQ12816 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
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