Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SYCNQ0VAF6 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYCNQ0VAF6 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms