Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
LOXL1Q08397 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC12.52□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LOXL1Q08397 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms