Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GOLGA3Q08378 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms