Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms