Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNDQ07001 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms