Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms