Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NUCB1Q02818 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms