Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UFM1P61960 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UFM1P61960 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UFM1P61960 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UFM1P61960 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UFM1P61960 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UFM1P61960 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UFM1P61960 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UFM1P61960 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UFM1P61960 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UFM1P61960 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UFM1P61960 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UFM1P61960 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UFM1P61960 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UFM1P61960 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UFM1P61960 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UFM1P61960 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
UFM1P61960 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UFM1P61960 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UFM1P61960 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UFM1P61960 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UFM1P61960 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UFM1P61960 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UFM1P61960 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UFM1P61960 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UFM1P61960 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UFM1P61960 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UFM1P61960 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UFM1P61960 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UFM1P61960 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UFM1P61960 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UFM1P61960 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UFM1P61960 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UFM1P61960 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UFM1P61960 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UFM1P61960 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UFM1P61960 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UFM1P61960 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UFM1P61960 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UFM1P61960 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UFM1P61960 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UFM1P61960 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UFM1P61960 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UFM1P61960 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UFM1P61960 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UFM1P61960 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UFM1P61960 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UFM1P61960 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UFM1P61960 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
UFM1P61960 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
UFM1P61960 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UFM1P61960 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UFM1P61960 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UFM1P61960 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UFM1P61960 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UFM1P61960 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UFM1P61960 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
UFM1P61960 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UFM1P61960 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UFM1P61960 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UFM1P61960 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UFM1P61960 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UFM1P61960 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UFM1P61960 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UFM1P61960 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UFM1P61960 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UFM1P61960 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UFM1P61960 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UFM1P61960 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UFM1P61960 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UFM1P61960 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UFM1P61960 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UFM1P61960 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UFM1P61960 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UFM1P61960 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UFM1P61960 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UFM1P61960 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UFM1P61960 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UFM1P61960 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UFM1P61960 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UFM1P61960 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UFM1P61960 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UFM1P61960 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UFM1P61960 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UFM1P61960 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UFM1P61960 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UFM1P61960 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UFM1P61960 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UFM1P61960 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UFM1P61960 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UFM1P61960 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UFM1P61960 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UFM1P61960 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UFM1P61960 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UFM1P61960 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UFM1P61960 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UFM1P61960 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UFM1P61960 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UFM1P61960 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UFM1P61960 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms