Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
ERVK-21P61565 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVK-21P61565 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms