Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2FP61218 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2FP61218 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms