Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSCP56915 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSCP56915 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSCP56915 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSCP56915 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GSCP56915 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSCP56915 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GSCP56915 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSCP56915 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSCP56915 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSCP56915 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSCP56915 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSCP56915 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSCP56915 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSCP56915 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSCP56915 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSCP56915 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GSCP56915 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSCP56915 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSCP56915 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSCP56915 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSCP56915 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSCP56915 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSCP56915 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSCP56915 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSCP56915 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSCP56915 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSCP56915 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSCP56915 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSCP56915 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSCP56915 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSCP56915 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSCP56915 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GSCP56915 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSCP56915 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSCP56915 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSCP56915 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GSCP56915 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSCP56915 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSCP56915 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSCP56915 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSCP56915 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSCP56915 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSCP56915 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSCP56915 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSCP56915 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSCP56915 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSCP56915 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSCP56915 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSCP56915 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSCP56915 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSCP56915 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSCP56915 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSCP56915 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSCP56915 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GSCP56915 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSCP56915 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSCP56915 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSCP56915 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSCP56915 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSCP56915 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSCP56915 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSCP56915 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GSCP56915 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSCP56915 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSCP56915 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSCP56915 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSCP56915 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSCP56915 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSCP56915 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSCP56915 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSCP56915 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSCP56915 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSCP56915 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GSCP56915 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSCP56915 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSCP56915 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSCP56915 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSCP56915 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSCP56915 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSCP56915 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSCP56915 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSCP56915 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSCP56915 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSCP56915 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSCP56915 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSCP56915 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSCP56915 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSCP56915 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSCP56915 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSCP56915 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSCP56915 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSCP56915 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSCP56915 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSCP56915 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GSCP56915 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSCP56915 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSCP56915 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSCP56915 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSCP56915 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms