Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DAP3P51398 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DAP3P51398 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DAP3P51398 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DAP3P51398 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DAP3P51398 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DAP3P51398 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DAP3P51398 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DAP3P51398 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DAP3P51398 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
DAP3P51398 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DAP3P51398 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DAP3P51398 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DAP3P51398 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DAP3P51398 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DAP3P51398 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
DAP3P51398 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DAP3P51398 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
DAP3P51398 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
DAP3P51398 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
DAP3P51398 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
DAP3P51398 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
DAP3P51398 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
DAP3P51398 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
DAP3P51398 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
DAP3P51398 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
DAP3P51398 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DAP3P51398 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DAP3P51398 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DAP3P51398 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DAP3P51398 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DAP3P51398 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DAP3P51398 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms