Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC4A3P48751 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms