Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CTRLP40313 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CTRLP40313 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CTRLP40313 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CTRLP40313 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CTRLP40313 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CTRLP40313 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CTRLP40313 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CTRLP40313 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CTRLP40313 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CTRLP40313 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CTRLP40313 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CTRLP40313 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CTRLP40313 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CTRLP40313 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CTRLP40313 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CTRLP40313 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CTRLP40313 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CTRLP40313 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CTRLP40313 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CTRLP40313 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CTRLP40313 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CTRLP40313 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CTRLP40313 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CTRLP40313 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CTRLP40313 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CTRLP40313 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CTRLP40313 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CTRLP40313 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CTRLP40313 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CTRLP40313 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CTRLP40313 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CTRLP40313 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CTRLP40313 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CTRLP40313 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CTRLP40313 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CTRLP40313 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CTRLP40313 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CTRLP40313 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CTRLP40313 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CTRLP40313 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CTRLP40313 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CTRLP40313 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CTRLP40313 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CTRLP40313 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CTRLP40313 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CTRLP40313 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CTRLP40313 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CTRLP40313 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CTRLP40313 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CTRLP40313 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms