Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA4P35212 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA4P35212 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA4P35212 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA4P35212 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA4P35212 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA4P35212 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA4P35212 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA4P35212 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA4P35212 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA4P35212 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA4P35212 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA4P35212 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA4P35212 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA4P35212 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA4P35212 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA4P35212 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA4P35212 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA4P35212 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA4P35212 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA4P35212 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA4P35212 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA4P35212 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA4P35212 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA4P35212 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA4P35212 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA4P35212 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA4P35212 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA4P35212 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA4P35212 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJA4P35212 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA4P35212 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA4P35212 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA4P35212 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA4P35212 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA4P35212 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA4P35212 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA4P35212 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA4P35212 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA4P35212 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA4P35212 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA4P35212 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA4P35212 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA4P35212 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA4P35212 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA4P35212 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA4P35212 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA4P35212 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA4P35212 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA4P35212 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA4P35212 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA4P35212 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA4P35212 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA4P35212 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA4P35212 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA4P35212 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA4P35212 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA4P35212 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA4P35212 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA4P35212 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA4P35212 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA4P35212 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA4P35212 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA4P35212 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA4P35212 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA4P35212 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA4P35212 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA4P35212 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA4P35212 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA4P35212 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA4P35212 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA4P35212 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA4P35212 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA4P35212 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA4P35212 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA4P35212 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA4P35212 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA4P35212 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA4P35212 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA4P35212 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA4P35212 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA4P35212 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA4P35212 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA4P35212 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJA4P35212 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA4P35212 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA4P35212 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA4P35212 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA4P35212 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA4P35212 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA4P35212 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA4P35212 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA4P35212 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA4P35212 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA4P35212 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA4P35212 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA4P35212 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA4P35212 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA4P35212 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJA4P35212 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms