Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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CASQ1P31415 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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CASQ1P31415 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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CASQ1P31415 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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CASQ1P31415 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
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CASQ1P31415 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
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CASQ1P31415 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASQ1P31415 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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